MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 108585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019738	GTA	2	6	79615	79620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308444
1002	NC_019738	GTT	2	6	79653	79658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308444
1003	NC_019738	ATGG	2	8	79714	79721	25 %	25 %	50 %	0 %	428308444
1004	NC_019738	GA	3	6	79798	79803	50 %	0 %	50 %	0 %	428308444
1005	NC_019738	TGC	2	6	79873	79878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308444
1006	NC_019738	TAC	2	6	79880	79885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308444
1007	NC_019738	CTT	2	6	79897	79902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308444
1008	NC_019738	CCG	2	6	79972	79977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308444
1009	NC_019738	GAC	2	6	79982	79987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308444
1010	NC_019738	CAAA	2	8	80007	80014	75 %	0 %	0 %	25 %	428308444
1011	NC_019738	GAA	2	6	80046	80051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308444
1012	NC_019738	CTT	2	6	80123	80128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308444
1013	NC_019738	GGA	2	6	80241	80246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308444
1014	NC_019738	GAA	2	6	80352	80357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308444
1015	NC_019738	TGG	2	6	80369	80374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308444
1016	NC_019738	TGG	2	6	80402	80407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308444
1017	NC_019738	CAG	2	6	80476	80481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308444
1018	NC_019738	ATT	2	6	80674	80679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308445
1019	NC_019738	GCTG	2	8	80734	80741	0 %	25 %	50 %	25 %	428308445
1020	NC_019738	ATG	2	6	80768	80773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308445
1021	NC_019738	AGT	2	6	80882	80887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308445
1022	NC_019738	TCT	2	6	80999	81004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308446
1023	NC_019738	AACC	2	8	81081	81088	50 %	0 %	0 %	50 %	428308447
1024	NC_019738	TTC	2	6	81165	81170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308447
1025	NC_019738	TTG	2	6	81256	81261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308448
1026	NC_019738	TCA	2	6	81482	81487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308449
1027	NC_019738	AG	3	6	81488	81493	50 %	0 %	50 %	0 %	428308449
1028	NC_019738	CAC	2	6	81514	81519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308449
1029	NC_019738	TATCAA	2	12	81558	81569	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428308449
1030	NC_019738	CAA	2	6	81685	81690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308449
1031	NC_019738	AC	3	6	81725	81730	50 %	0 %	0 %	50 %	428308449
1032	NC_019738	GCC	2	6	81782	81787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308449
1033	NC_019738	GGTA	2	8	81796	81803	25 %	25 %	50 %	0 %	428308449
1034	NC_019738	AG	3	6	81805	81810	50 %	0 %	50 %	0 %	428308449
1035	NC_019738	TCG	2	6	81968	81973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308449
1036	NC_019738	CCG	2	6	82026	82031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308449
1037	NC_019738	A	6	6	82061	82066	100 %	0 %	0 %	0 %	428308449
1038	NC_019738	AAGG	2	8	82076	82083	50 %	0 %	50 %	0 %	428308449
1039	NC_019738	G	6	6	82118	82123	0 %	0 %	100 %	0 %	428308449
1040	NC_019738	CTT	2	6	82161	82166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308449
1041	NC_019738	TCA	2	6	82178	82183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308449
1042	NC_019738	CTT	2	6	82224	82229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308449
1043	NC_019738	CTCAGA	2	12	82249	82260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308449
1044	NC_019738	TTGA	2	8	82264	82271	25 %	50 %	25 %	0 %	428308449
1045	NC_019738	AGG	2	6	82306	82311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308449
1046	NC_019738	ACC	2	6	82421	82426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308449
1047	NC_019738	CTTC	2	8	82482	82489	0 %	50 %	0 %	50 %	428308449
1048	NC_019738	TAGA	2	8	82616	82623	50 %	25 %	25 %	0 %	428308449
1049	NC_019738	TCA	2	6	82634	82639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308449
1050	NC_019738	TCC	2	6	82643	82648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308449
1051	NC_019738	CTT	2	6	82650	82655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308449
1052	NC_019738	TGA	2	6	82708	82713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308449
1053	NC_019738	TCT	2	6	82751	82756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308449
1054	NC_019738	TAG	2	6	82821	82826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308449
1055	NC_019738	ATT	2	6	82846	82851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308449
1056	NC_019738	CAA	2	6	82860	82865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308449
1057	NC_019738	CTT	2	6	82914	82919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308449
1058	NC_019738	TGG	2	6	82933	82938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308449
1059	NC_019738	CGA	2	6	83191	83196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308449
1060	NC_019738	CCAA	2	8	83198	83205	50 %	0 %	0 %	50 %	428308449
1061	NC_019738	GGTT	2	8	83284	83291	0 %	50 %	50 %	0 %	428308449
1062	NC_019738	GGC	2	6	83303	83308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308449
1063	NC_019738	GAA	2	6	83321	83326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308449
1064	NC_019738	GCG	2	6	83340	83345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308449
1065	NC_019738	CAAGT	2	10	83368	83377	40 %	20 %	20 %	20 %	428308449
1066	NC_019738	AG	3	6	83390	83395	50 %	0 %	50 %	0 %	428308449
1067	NC_019738	TCCT	2	8	83416	83423	0 %	50 %	0 %	50 %	428308449
1068	NC_019738	AAT	2	6	83497	83502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308449
1069	NC_019738	CAC	2	6	83793	83798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308449
1070	NC_019738	CTC	2	6	83853	83858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308449
1071	NC_019738	CTT	2	6	83874	83879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308449
1072	NC_019738	GTG	2	6	83912	83917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308449
1073	NC_019738	CTC	2	6	83929	83934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308449
1074	NC_019738	TCT	2	6	84104	84109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308449
1075	NC_019738	CAA	2	6	84171	84176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308449
1076	NC_019738	GAT	2	6	84221	84226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308449
1077	NC_019738	AGG	2	6	84235	84240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308449
1078	NC_019738	CTG	2	6	84271	84276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308449
1079	NC_019738	GAT	2	6	84286	84291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308449
1080	NC_019738	CTC	2	6	84316	84321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308449
1081	NC_019738	CCT	2	6	84333	84338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308449
1082	NC_019738	GCG	2	6	84399	84404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308449
1083	NC_019738	TCT	2	6	84416	84421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308449
1084	NC_019738	CT	4	8	84424	84431	0 %	50 %	0 %	50 %	428308449
1085	NC_019738	C	6	6	84438	84443	0 %	0 %	0 %	100 %	428308449
1086	NC_019738	CTG	2	6	84670	84675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308449
1087	NC_019738	A	6	6	84689	84694	100 %	0 %	0 %	0 %	428308449
1088	NC_019738	AGGT	2	8	84743	84750	25 %	25 %	50 %	0 %	428308449
1089	NC_019738	TAC	2	6	84760	84765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308449
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1092	NC_019738	GAG	2	6	84878	84883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308449
1093	NC_019738	ACG	2	6	84890	84895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308449
1094	NC_019738	GTA	2	6	84963	84968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308449
1095	NC_019738	CCT	2	6	85257	85262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308450
1096	NC_019738	CGG	2	6	85404	85409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308450
1097	NC_019738	GAG	2	6	85449	85454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308450
1098	NC_019738	TGC	2	6	85466	85471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308450
1099	NC_019738	C	6	6	85529	85534	0 %	0 %	0 %	100 %	428308450
1100	NC_019738	CAA	2	6	85687	85692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308450
1101	NC_019738	TGC	2	6	85694	85699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308450
1102	NC_019738	TCT	2	6	85901	85906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308450
1103	NC_019738	TGA	2	6	86036	86041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308450
1104	NC_019738	TCCG	2	8	86276	86283	0 %	25 %	25 %	50 %	428308450
1105	NC_019738	TCC	2	6	86372	86377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308450
1106	NC_019738	ATG	2	6	86439	86444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308450
1107	NC_019738	GACTT	2	10	86576	86585	20 %	40 %	20 %	20 %	428308451
1108	NC_019738	ATG	2	6	86599	86604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308451
1109	NC_019738	CCG	2	6	86605	86610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308451
1110	NC_019738	AAACC	2	10	86617	86626	60 %	0 %	0 %	40 %	428308451
1111	NC_019738	TGA	2	6	86706	86711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308451
1112	NC_019738	GCA	2	6	86713	86718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308451
1113	NC_019738	TCAAG	2	10	86763	86772	40 %	20 %	20 %	20 %	428308452
1114	NC_019738	GTG	2	6	86833	86838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308452
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1116	NC_019738	CAC	2	6	87046	87051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308452
1117	NC_019738	CAA	2	6	87058	87063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308452
1118	NC_019738	GGTT	2	8	87092	87099	0 %	50 %	50 %	0 %	428308452
1119	NC_019738	AGC	2	6	87134	87139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308452
1120	NC_019738	CCAGAA	2	12	87180	87191	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428308452
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1252	NC_019738	GTC	2	6	98562	98567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308461
1253	NC_019738	TCT	2	6	98602	98607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308461
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1255	NC_019738	GTG	2	6	98709	98714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308461
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1266	NC_019738	AG	3	6	99618	99623	50 %	0 %	50 %	0 %	428308462
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1284	NC_019738	TCG	2	6	100479	100484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308462
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1496	NC_019738	TTC	2	6	114013	114018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308472
1497	NC_019738	CGA	2	6	114045	114050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308472
1498	NC_019738	T	6	6	114087	114092	0 %	100 %	0 %	0 %	428308472
1499	NC_019738	CTC	2	6	114178	114183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308473
1500	NC_019738	CAT	2	6	114190	114195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308473

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